Es gibt drei große Untergruppen, die von Bedeutung sind. Die erste und wohl edelste ist Muscat Blanc à Petits Grains Ronds, die internationale Bezeichnung für den Gelben Muskateller. Sie kommt hauptsächlich im nördlichen Mittelmeerraum vor. Ein weiteres Mitglied der Muskatellerfamilie ist die aus Griechenland stammende Muscat d’Alexandrie, die man hauptsächlich im südlichen Mittelmeerraum findet. Speziell für Österreich ist noch der Muskat Ottonel relevant, welcher aus Frankreich kommt, aber hauptsächlich in Südosteuropa angebaut wird.